Son toponyme médiéval : "Sanctus Germanus Rocatus" en 1100.
Le village de Saint-Germain-le-Rocheux est situé en bordure de la forêt de Châtillon sur un plateau qui domine la vallée du Brevon. Construit sur un monticule avec l'église romane au sommet, et tout autour de très vieilles bâtisses, fontaines, bélier en lave, ex-voto, et calvaire.
Autrefois, les moines défricheurs logeaient dans une bâtisse "La Monnerie" dépendant de l'abbaye du Val-des-Choux.